Слово боями может употребляться в 2-х разных значениях:
I. боя́ми — творительный падеж, множественное число слова бой (битва)
В слове «боями» ударение падает на слог с буквой Я — боЯми.
II. бо́ями — творительный падеж, множественное число слова бой (слуга)
В упомянутом выше варианте ударение следует ставить на слог с буквой О — бОями.