Слово запахнут может употребляться в 2-х разных значениях:
I. запа́хнут — от слова запахнуть (издать запах)
В таком варианте ударение падает на слог с последней буквой А — запАхнут.
II. запахну́т — от слова запахнуть (полы одежды)
В данном слове допускается ставить ударение либо на слог с буквой У — запахнУт, либо на слог с последней буквой А — запАхнут.