Слово капель может употребляться в 2-х разных значениях:
I. капе́ль — существительное
В слове «капель» ударение падает на слог с буквой Е — капЕль.
II. ка́пель — родительный падеж, множественное число слова капли (микстура)
В слове «капель» ударение падает на слог с буквой А — кАпель.