Слово месяцами может употребляться в 2-х разных значениях:
I. ме́сяцами — творительный падеж, множественное число слова месяц
В указанном выше варианте ударение должно быть поставлено на слог с буквой Е — мЕсяцами.
II. месяца́ми — наречие
В данном варианте ударение ставят на слог с буквой А — месяцАми.