Слово понятыми может употребляться в 2-х разных значениях:
I. поняты́ми — творительный падеж, множественное число слова понятой
В данном варианте ударение следует ставить на слог с буквой Ы — понятЫми.
II. по́нятыми — от слова понять
В слове «понятыми» ударение падает на слог с буквой О — пОнятыми.