Слово скирдами может употребляться в 2-х разных значениях:
I. скирда́ми — творительный падеж, множественное число слова скирд
В таком варианте ударение должно быть поставлено на слог с буквой А — скирдАми.
II. ски́рдами — творительный падеж, множественное число слова скирда
В данном слове допускается ставить ударение либо на слог с первой буквой И — скИрдами, либо на слог с буквой А — скирдАми.