Слово стопы может употребляться в 2-х разных значениях:
I. стопы́ — родительный падеж слова стопа (часть ноги)
В слове «стопы» ударение падает на слог с буквой Ы — стопЫ.
II. сто́пы — множественное число слова стопа (часть стиха; куча; сосуд)
В слове «стопы» ударение падает на слог с буквой О — стОпы.