Слово щелочи может употребляться в 2-х разных значениях:
I. щелочи́ — от слова щелочить
В указанном выше варианте ударение должно быть поставлено на слог с буквой И — щелочИ.
II. щёлочи — родительный падеж слова щёлочь
В упомянутом выше варианте ударение падает на слог с буквой Ё — щЁлочи.