Слово губы может употребляться в 2-х разных значениях:
I. губы́ — родительный падеж слова губа (орган)
В слове «губы» ударение падает на слог с буквой Ы — губЫ.
II. гу́бы — множественное число слова губа (орган)
В упомянутом выше варианте ударение ставят на слог с буквой У — гУбы.