Слово глотка может употребляться в 2-х разных значениях:
I. гло́тка — существительное
В слове «глотка» ударение падает на слог с буквой О — глОтка.
II. глотка́ — родительный падеж слова глоток
В таком варианте ударение ставят на слог с буквой А — глоткА.