Слово начинён может употребляться в 2-х разных значениях:
I. начинён — от слова начинить (наполнить)
В слове «начинен» ударение падает на слог с буквой Ё — начинЁн.
II. начи́нен — от слова начинить (починить или очинить в некотором количестве)
В слове «начинен» ударение падает на слог с буквой И — начИнен.