Слово полы может употребляться в 2-х разных значениях:
I. полы́ — множественное число слова пол (настил)
В слове «полы» ударение падает на слог с буквой Ы — полЫ.
II. по́лы — множественное число слова пол (биол.)
В упомянутом выше варианте ударение следует ставить на слог с буквой О — пОлы.