Слово четы может употребляться в 3-х разных значениях:
I. че́ты — родительный падеж слова чета (партизанский отряд у южных славян)
В указанном выше варианте ударение должно быть поставлено на слог с буквой Е — чЕты.
II. четы́ — родительный падеж слова чета (пара)
В слове «четы» ударение падает на слог с буквой Ы — четЫ.
III. чёты — множественное число слова чёт
В упомянутом выше варианте ударение должно быть поставлено на слог с буквой Ё — чЁты.