Слово щепы может употребляться в 2-х разных значениях:
I. щепы́ — родительный падеж слова щепа (мн. преимущ. в выражении разнести в щепы)
В слове «щепы» ударение падает на слог с буквой Ы — щепЫ.
II. ще́пы — множественное число слова щепа (мн. преимущ. в выражении разнести в щепы)
В указанном выше варианте ударение следует ставить на слог с буквой Е — щЕпы.