Слово летом может употребляться в 2-х разных значениях:
I. ле́том — творительный падеж слова лето (см. также лета и год)
В слове «лётом» ударение падает на слог с буквой Е — лЕтом.
II. лётом — творительный падеж слова лёт
В данном варианте ударение должно быть поставлено на слог с буквой Ё — лЁтом.