Слово отсек может употребляться в 2-х разных значениях:
I. отсе́к — существительное
В указанном выше варианте ударение ставят на слог с буквой Е — отсЕк.
II. отсёк — от слова отсечь (но прош. м отсёк//устар. отсек, прич.прош. отсекший)
В слове «отсек» ударение падает на слог с буквой Ё — отсЁк.