Слово купола может употребляться в 2-х разных значениях:
I. ку́пола — родительный падеж слова купол
В слове «купола» ударение падает на слог с буквой У — кУпола.
II. купола́ — множественное число слова купол
В данном варианте ударение ставят на слог с буквой А — куполА.