Слово межи может употребляться в 2-х разных значениях:
I. межи́ — родительный падеж слова межа
В слове «межи» ударение падает на слог с буквой И — межИ.
II. межи́ — множественное число слова межа
В данном слове допускается ставить ударение либо на слог с буквой И — межИ, либо на слог с буквой Е — мЕжи.